Le gouvernement azerbaïdjanais a officiellement promis de verser des indemnités au journaliste Agil Khalil pour les violations des droits de l'homme dont il a été victime. Ce faisant, le gouvernement azerbaïdjanais a formellement admis devant la Cour européenne des droits de l'homme qu'elle portait atteinte, entre autres, à son droit à la liberté d'expression, à son droit à la vie et à son droit d'être protégé contre les mauvais traitements.
En 2008, Agil Khalil – un journaliste pour Azadliq Un journaliste azerbaïdjanais a été violemment agressé par des agents du ministère de la Sécurité nationale alors qu'il tentait de prendre des photos pour un reportage d'investigation. Il a ensuite été suivi par un individu non identifié et, moins d'un mois après l'agression, a été attaqué par quatre hommes qui l'ont poignardé à la poitrine.
Suite à ces incidents, les autorités azerbaïdjanaises n'ont pas mené d'enquête efficace sur les attaques. Elles ont refusé d'enquêter sur les violences commises par des agents du ministère de la Sécurité nationale. De plus, lors de l'enquête concernant l'agression au couteau de Khalil, les enquêteurs l'ont soumis à des violences physiques et à des menaces afin de le contraindre à révéler l'identité de son agresseur. Khalil a été giflé, frappé et on lui a mis un sac plastique sur la tête jusqu'à ce qu'il avoue avoir été poignardé par son prétendu amant. Les enquêteurs ont également proféré des menaces de représailles contre sa famille et ont menacé de diffuser une vidéo où son prétendu amant avouerait l'agression. Khalil n'avait jamais rencontré cet individu et a nié toute relation avec lui. Malgré cela, il a été contraint de faire une déclaration contraire.
Il s'est avéré par la suite que les communications de Khalil étaient également interceptées durant l'enquête, ce qui a finalement mis en péril la protection de ses sources journalistiques. De plus, plusieurs SMS avaient été falsifiés afin d'obtenir la condamnation de sa prétendue maîtresse. Khalil reste persuadé que son agression au couteau a été commanditée par le ministère de la Sécurité nationale.
Après avoir fui l'Azerbaïdjan par crainte pour sa sécurité, Khalil a saisi la Cour européenne des droits de l'homme avec l'aide de l'organisation partenaire de MLDI en Azerbaïdjan, le Media Rights Institute. L'affaire a fait l'objet d'un accord, l'Azerbaïdjan s'engageant à verser 28 000 € à titre de dédommagement pour violation de ses droits. La Cour européenne des droits de l'homme a accepté cet accord. a indiqué à l'Azerbaïdjan qu'elle a toujours l'obligation de mener une enquête complète et efficace sur les attaques violentes perpétrées contre Khalil.
Nani Jansen, directrice juridique de MLDI, a déclaré : « Il s’agit d’une issue positive pour Khalil et j’espère sincèrement que l’Azerbaïdjan respectera les engagements pris devant la Cour européenne. L’Azerbaïdjan a systématiquement violé les droits des journalistes par le harcèlement, les agressions violentes, la surveillance, les accusations mensongères et un manquement flagrant à assurer leur sécurité dans le pays. Il est essentiel que l’Azerbaïdjan assume pleinement ses responsabilités et cesse de violer les droits des autres journalistes, notamment ceux de Khadija Ismaylova, emprisonnée en Azerbaïdjan. » violation flagrante de ses droits. »
MLDI a fourni un soutien juridique dans cette affaire et a financé les avocats qui représentaient Khalil par l'intermédiaire de l'Institut des droits des médias basé à Bakou. Depuis, l'Institut des droits des médias a été… contraint par le gouvernement de fermer.
